肯定要处理，一般纳税人注销时库存很大，税务机关要求进项转出，否则注销了，将来处理就自然涉及到缴税。所以注销前库存必须清理，进行纳税清算，最后才能注销税务登记。

对已认定为一般纳税人的新办商贸零售企业，但未从事货物零售业务的，应取消其一般纳税人资格。一般纳税人注销或被取消辅导期一般纳税人资格，转为小规模纳税人时，其存货不作进项税额转出处理，其留抵税额也不予退税。